Protein–RNA interactions for Protein: P01674

Ig kappa chain V-III region PC 2154, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01674 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01674 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01674 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01674 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01674 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01674 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01674 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01674 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01674 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01674 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01674 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01674 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01674 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01674 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01674 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01674 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01674 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01674 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01674 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01674 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01674 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01674 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01674 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01674 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01674 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01674 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01674 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01674 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01674 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01674 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01674 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01674 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01674 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01674 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01674 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01674 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01674 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01674 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01674 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01674 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01674 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01674 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01674 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01674 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01674 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01674 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01674 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01674 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01674 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01674 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01674 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01674 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01674 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01674 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01674 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01674 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01674 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01674 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01674 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01674 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01674 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01674 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01674 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01674 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01674 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01674 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01674 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01674 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01674 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01674 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01674 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01674 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01674 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01674 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01674 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01674 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01674 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01674 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01674 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01674 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01674 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01674 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01674 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01674 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01674 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms