Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01658 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01658 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01658 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01658 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01658 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01658 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01658 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01658 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01658 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01658 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01658 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01658 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01658 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01658 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01658 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01658 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01658 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01658 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01658 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01658 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01658 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01658 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01658 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01658 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01658 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01658 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01658 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01658 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01658 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01658 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01658 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01658 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01658 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01658 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01658 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01658 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01658 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01658 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01658 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01658 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01658 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01658 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01658 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01658 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01658 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01658 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01658 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01658 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01658 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01658 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01658 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01658 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01658 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01658 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01658 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01658 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01658 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01658 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01658 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01658 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01658 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01658 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01658 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01658 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01658 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01658 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01658 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01658 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01658 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01658 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01658 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01658 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01658 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01658 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01658 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01658 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01658 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01658 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01658 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01658 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01658 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01658 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01658 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01658 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01658 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01658 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01658 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01658 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01658 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01658 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01658 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01658 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01658 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01658 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01658 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01658 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01658 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01658 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01658 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms