Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01649 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01649 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01649 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01649 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01649 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01649 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01649 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01649 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01649 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01649 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01649 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01649 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01649 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01649 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01649 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01649 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01649 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01649 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01649 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01649 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01649 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01649 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01649 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01649 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01649 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01649 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01649 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01649 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01649 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01649 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01649 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01649 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01649 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01649 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01649 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01649 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01649 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01649 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01649 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01649 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01649 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01649 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01649 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01649 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01649 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01649 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01649 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01649 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01649 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01649 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01649 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01649 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01649 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01649 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01649 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01649 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01649 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01649 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01649 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01649 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01649 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01649 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01649 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01649 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01649 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01649 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms