Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01643 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01643 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01643 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01643 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01643 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01643 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01643 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01643 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01643 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01643 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01643 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01643 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01643 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01643 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01643 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01643 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01643 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01643 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01643 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01643 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01643 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01643 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01643 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01643 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01643 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01643 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01643 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01643 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01643 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01643 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01643 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01643 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01643 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01643 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01643 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01643 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01643 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01643 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01643 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01643 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01643 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01643 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01643 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01643 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01643 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01643 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01643 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01643 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01643 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01643 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01643 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms