Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apaf1O88879 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms