Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tom1O88746 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tom1O88746 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tom1O88746 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tom1O88746 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tom1O88746 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tom1O88746 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tom1O88746 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms