Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hcn2O88703 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hcn2O88703 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms