Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc27a3O88561 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms