Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Slc4a4O88343 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a4O88343 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms