Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec11aO88200 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms