Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtssO70370 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtssO70370 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtssO70370 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtssO70370 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtssO70370 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtssO70370 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtssO70370 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtssO70370 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtssO70370 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtssO70370 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtssO70370 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtssO70370 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtssO70370 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtssO70370 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CtssO70370 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtssO70370 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtssO70370 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtssO70370 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtssO70370 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtssO70370 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtssO70370 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtssO70370 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtssO70370 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtssO70370 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtssO70370 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtssO70370 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtssO70370 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtssO70370 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtssO70370 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtssO70370 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtssO70370 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtssO70370 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtssO70370 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtssO70370 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CtssO70370 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtssO70370 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtssO70370 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtssO70370 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtssO70370 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtssO70370 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtssO70370 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtssO70370 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtssO70370 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtssO70370 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtssO70370 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtssO70370 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtssO70370 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtssO70370 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtssO70370 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtssO70370 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtssO70370 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtssO70370 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtssO70370 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CtssO70370 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CtssO70370 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CtssO70370 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CtssO70370 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtssO70370 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CtssO70370 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtssO70370 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtssO70370 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtssO70370 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtssO70370 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtssO70370 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtssO70370 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CtssO70370 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtssO70370 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtssO70370 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtssO70370 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtssO70370 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtssO70370 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtssO70370 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtssO70370 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtssO70370 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtssO70370 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtssO70370 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtssO70370 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtssO70370 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtssO70370 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtssO70370 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtssO70370 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtssO70370 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtssO70370 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtssO70370 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtssO70370 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtssO70370 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtssO70370 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtssO70370 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtssO70370 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtssO70370 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtssO70370 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtssO70370 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CtssO70370 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtssO70370 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtssO70370 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtssO70370 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CtssO70370 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtssO70370 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtssO70370 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms