Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap1O55125 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap1O55125 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms