Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nck2O55033 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nck2O55033 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nck2O55033 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nck2O55033 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck2O55033 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nck2O55033 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nck2O55033 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nck2O55033 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nck2O55033 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms