Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms