Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tnk2O54967 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms