Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NfkbieO54910 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms