Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms