Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csnk2a2O54833 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms