Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DffaO54786 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DffaO54786 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DffaO54786 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DffaO54786 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DffaO54786 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DffaO54786 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DffaO54786 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DffaO54786 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DffaO54786 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DffaO54786 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DffaO54786 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DffaO54786 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DffaO54786 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DffaO54786 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DffaO54786 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DffaO54786 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DffaO54786 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DffaO54786 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DffaO54786 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DffaO54786 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DffaO54786 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DffaO54786 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DffaO54786 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DffaO54786 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DffaO54786 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DffaO54786 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DffaO54786 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DffaO54786 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DffaO54786 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DffaO54786 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DffaO54786 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DffaO54786 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DffaO54786 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DffaO54786 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DffaO54786 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DffaO54786 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DffaO54786 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DffaO54786 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DffaO54786 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DffaO54786 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DffaO54786 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DffaO54786 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DffaO54786 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DffaO54786 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DffaO54786 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DffaO54786 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DffaO54786 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DffaO54786 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DffaO54786 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DffaO54786 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DffaO54786 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DffaO54786 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DffaO54786 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DffaO54786 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DffaO54786 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DffaO54786 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DffaO54786 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DffaO54786 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DffaO54786 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DffaO54786 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DffaO54786 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DffaO54786 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DffaO54786 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DffaO54786 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DffaO54786 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DffaO54786 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DffaO54786 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DffaO54786 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DffaO54786 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DffaO54786 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DffaO54786 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DffaO54786 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DffaO54786 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DffaO54786 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DffaO54786 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DffaO54786 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DffaO54786 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DffaO54786 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DffaO54786 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DffaO54786 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DffaO54786 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DffaO54786 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DffaO54786 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DffaO54786 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DffaO54786 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
DffaO54786 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DffaO54786 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DffaO54786 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DffaO54786 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DffaO54786 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DffaO54786 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DffaO54786 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DffaO54786 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DffaO54786 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DffaO54786 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DffaO54786 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DffaO54786 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DffaO54786 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DffaO54786 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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