Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms