Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek2O35942 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek2O35942 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek2O35942 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek2O35942 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek2O35942 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek2O35942 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek2O35942 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek2O35942 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek2O35942 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek2O35942 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek2O35942 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek2O35942 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms