Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrcpO35427 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrcpO35427 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrcpO35427 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CrcpO35427 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrcpO35427 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms