Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppef2O35385 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppef2O35385 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms