Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d1bO35324 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms