Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn9O35239 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms