Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe40O35185 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe40O35185 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms