Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarb2O35114 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarb2O35114 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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