Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Degs1O09005 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Degs1O09005 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Degs1O09005 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Degs1O09005 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Degs1O09005 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Degs1O09005 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Degs1O09005 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Degs1O09005 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Degs1O09005 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Degs1O09005 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Degs1O09005 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Degs1O09005 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Degs1O09005 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Degs1O09005 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Degs1O09005 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Degs1O09005 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Degs1O09005 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Degs1O09005 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Degs1O09005 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Degs1O09005 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Degs1O09005 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Degs1O09005 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Degs1O09005 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Degs1O09005 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Degs1O09005 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Degs1O09005 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Degs1O09005 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Degs1O09005 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Degs1O09005 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Degs1O09005 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Degs1O09005 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Degs1O09005 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Degs1O09005 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Degs1O09005 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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