Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PrkcshO08795 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms