Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfil3O08750 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms