Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp12O08736 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp12O08736 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp12O08736 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp12O08736 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp12O08736 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp12O08736 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp12O08736 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp12O08736 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp12O08736 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp12O08736 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms