Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3488M0QW81 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3488M0QW81 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3488M0QW81 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3488M0QW81 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3488M0QW81 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3488M0QW81 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3488M0QW81 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3488M0QW81 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3488M0QW81 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3488M0QW81 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3488M0QW81 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3488M0QW81 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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