Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20878L7N244 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20878L7N244 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20878L7N244 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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