Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms