Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp955bL7N232 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms