Protein–RNA interactions for Protein: K9J7H2

Gm4141, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4141K9J7H2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4141K9J7H2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm4141K9J7H2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm4141K9J7H2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms