Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms