Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5294J3QP53 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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