Protein–RNA interactions for Protein: J3QP07

B020004C17Rik, RIKEN cDNA B020004C17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020004C17RikJ3QP07 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B020004C17RikJ3QP07 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B020004C17RikJ3QP07 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms