Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17577J3QNF7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17577J3QNF7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17577J3QNF7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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