Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20918J3QN17 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20918J3QN17 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms