Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf4bG5E8Z2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4bG5E8Z2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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