Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf148G3X9R7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf148G3X9R7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms