Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arfgef1G3X9K3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arfgef1G3X9K3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms