Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zc3h12bG3X9I7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zc3h12bG3X9I7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zc3h12bG3X9I7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zc3h12bG3X9I7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zc3h12bG3X9I7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zc3h12bG3X9I7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zc3h12bG3X9I7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zc3h12bG3X9I7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zc3h12bG3X9I7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1116.8 ms