Protein–RNA interactions for Protein: G3X992

Msl3l2, MSL3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3l2G3X992 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl3l2G3X992 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msl3l2G3X992 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msl3l2G3X992 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msl3l2G3X992 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msl3l2G3X992 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msl3l2G3X992 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msl3l2G3X992 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msl3l2G3X992 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msl3l2G3X992 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msl3l2G3X992 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msl3l2G3X992 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msl3l2G3X992 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msl3l2G3X992 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msl3l2G3X992 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msl3l2G3X992 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl3l2G3X992 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl3l2G3X992 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl3l2G3X992 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl3l2G3X992 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl3l2G3X992 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl3l2G3X992 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl3l2G3X992 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms