Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8909G3UXE9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8909G3UXE9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8909G3UXE9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8909G3UXE9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8909G3UXE9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8909G3UXE9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8909G3UXE9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 335.2 ms