Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ScaperF8VQ70 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms