Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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