Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm17654F7AXR3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17654F7AXR3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms